آنالیز باکتری‌های موثر گیاه با رامان
امروزه کشاورزی با چالش‌های بسیاری روبه رو است. خشکسالی ناشی از تغییرات آب و هوایی، کاهش زمین‌های قابل کشت، کاهش کیفیت آب و مصرف کودهای شیمیایی تعدادی از این چالش‌ها محسوب می‌شوند. در صنعت کشاورزی توسعه کودها و بهبود کیفتشان از اهمیت بالایی برخوردار است. این کودها علاوه بر تغذیه گیاهان، در افزایش اثرات مثبت باکتری‌های مفید خاک نیز استفاده می‌شوند. طیف سنجی یکی از روش‌های کاربردی در مطالعه باکتری‌های مفید خاک و میکروبیوم گیاه است. میکروبیوم (microbiome) گیاه، یک لایه دفاعی برای محصولات در حال رشد است.
محققان دانشگاه ایالتی در آمریکا از طیف سنج رامان برای تجزیه و تحلیل باکتری‌های داخل خاک استفاده کرده‌اند. آن‌ها دو عامل آبیوتیک استرس‌زا را بر روی Pseudomonas chlororaphis O6 (PcO6) بررسی کرده‌اند. PcO6 یک باکتری برای افزایش سلامت ریشه‌های گندم در دشت شمال آن ایالت است. آن‌ها متوجه شدند که استرس می‌تواند باعث تغییر غشای خارجی باکتری‌ای به نام (outer membrane vesicles (OMVs)) شود.
دانشمندان مدت‌ها است می‌دانند که سلول‌های باکتریایی، OMV آزاد می‌کنند. اما در این مطالعه به دنبال پیدا کردن عوامل موثر در آزاد شدن آن‌ها هستند. هم چنین به دنبال راهی برای بالابردن کارایی این ساختارها به نفع محصول می‌گردند.
محققان به کمک طیف سنجی رامان و علم داده به دنبال مشخصه یابی نوع استرسی هستند که باکتری‌ها زمان انتشار OMVها و تغییرات ترکیبی وابسته به استرس تجربه می‌کنند. این تغییرات مشاهده شده، پیامدی برای ارتباط سلول-سلول و باکتری-گیاه است. لازم به ذکر است که این ارتباط‌ها برای درک بهتر میکروبیوم گیاه ضروری هستند.
منبع خبر
۱- https://zaya.io/d581l
